Protejat de urbanizare timp de peste un mileniu, Muntele Athos a păstrat un ecosistem de o bogăție extraordinară. Peninsula este un refugiu pentru specii rare de plante și animale, un adevărat muzeu viu al naturii mediteraneene.
Pădurile seculare
Athos este acoperit în proporție de peste 60% de păduri, multe cu arbori seculari:
- Castani — păduri impresionante, unii arbori cu vârsta de peste 500 de ani
- Stejari — varietăți mediteraneene și balcanice
- Pini — dominanți pe versanții sudici
- Chiparoși — în special în jurul mănăstirilor
Plante rare
Pe Sfântul Munte au fost identificate peste 1.500 de specii de plante, dintre care câteva sunt endemice (nu se găsesc nicăieri altundeva). Grădinile mănăstirilor cultivă plante medicinale, legume și flori de secole.
Fauna
Fauna este diversă și include:
- Vulturi, ulii și alte păsări răpitoare
- Căprioare și mistreți
- Foci monahale pe coastele sudice (una dintre cele mai rare mamifere marine)
- Broaște țestoase — atât terestre cât și marine
Protecție naturală
Statutul special al Muntelui Athos funcționează ca o rezervație naturală de facto. Lipsa dezvoltării comerciale, a turismului de masă și a agriculturii intensive a permis naturii să prospereze.